Το SQLite διαβάζει και γράφει μικρά blobs (π.χ., μικρογραφίες εικόνων) 35% πιο γρήγορα από τη χρήση μεμονωμένων αρχείων στον δίσκο, και χρησιμοποιεί περίπου 20% λιγότερο χώρο στον δίσκο.
Η αποδοτικότητα αποδίδεται σε λιγότερες κλήσεις συστήματος open() και close() και σε πιο σφιχτή συσκευασία δεδομένων, με την απόδοση να αναμένεται να βελτιωθεί σε μελλοντικές εκδόσεις.
Οι δοκιμές δείχνουν ότι το SQLite γενικά υπερτερεί σε σχέση με την άμεση είσοδο/έξοδο αρχείων, ειδικά στα Windows με ενεργοποιημένο λογισμικό προστασίας από ιούς, αν και η απόδοση μπορεί να διαφέρει ανάλογα με το υλικό και το λειτουργικό σύστημα.
Το SQLite είναι 35% ταχύτερο από τα παραδοσιακά συστήματα αρχείων λόγω λιγότερων κλήσεων συστήματος ανοίγματος/κλεισίματος και της απουσίας ανάγκης για χαρακτηριστικά συστήματος αρχείων ή ελέγχους μεταδεδομένων.
Αυτή η αύξηση της απόδοσης είναι ιδιαίτερα σημαντική στα Windows, όπου οι κλήσεις στο σύστημα αρχείων είναι εγγενώς πιο αργές.
Παρά ορισμένους περιορισμούς, όπως το μέγιστο μέγεθος blob των 2GB και τις προκλήσεις με ιεραρχικά δεδομένα, η ταχύτητα και η απλότητα του SQLite το καθιστούν πλεονεκτικό για καταγραφές και άλλες αποθηκεύσεις δεδομένων.